De acuerdo con la Auditoría Superior de la Federación en 2008, Conaculta otorgó recursos por 1,296 millones de pesos sin que se cumpliera con la totalidad de las formalidades establecidas. De ese análisis se desprenden las siguientes deficiencias:
Se emplearon los términos de “Apoyo” y “Donativos” indistintamente sin indicar la definición precisa para cada concepto, así como su uso y manejo.
No se definieron criterios para identificar cómo se aplicarían los recursos y los porcentajes que podrían utilizarse para gastos de operación y administración de los proyectos.
No se estableció como obligación para los beneficiarios de los recursos el entregar copia de los comprobantes originales de facturas y/o recibos fiscales que amparen los conceptos del gasto realizado a las áreas del Conaculta encargadas del seguimiento.